かすみさん、こんにちわ。
ご質問に私のできる範囲でお答えしたいと思います。

１）SF→ディスニーランド
一番早いのはやはり飛行機です。SFからLos Angels Airport(LAX)またはJohn Wayne Airport (SNA,Orange County)が近郊にあります。
バスもいいと思います。申し訳ないのですがPeterpan busは知りませんでした。私の義理の母は南カリフォルニアに住んでいて、SFに来る時はいつもMega busを使っています。SFを夜１１時頃に出発して朝７時頃に到着するようです。ウェブサイトではLA着とAnaheim着があるようで、片道＄５０弱のようです。
https://us.megabus.com/.aspx
時間的に列車はお薦めしません。
どちらにするかは、かすみさんのご旅行の日程によるのではないでしょうか。

２）サンフランシスコとラスベガスのクリスマス。
残念ながら、クリスマスシーズンはどちらも安くはないと思います。
サンフランシスコのホテルに関しては、クリスマスシーズン中はどこも高いでしょう。強いて言えば、ダウンタウン、フィッシャーマンズワーフから離れた所が狙い目でしょうが、そう安くはないと思います。逆に安い所は汚なかったり、治安があまり良くない所、かなり不便な場所になってしまうでしょう。
ラスベガスはわかりません。ごめんなさい。

３）西海岸の宿泊
ホステル、airbnb、B&B、小ホテル、モーテルでも安全だと思います。要は、どの宿泊施設でも立地している場所が治安のよい地域か否かです。また、安全性、金額、利便性のどれを最優先にするかも重要なポイントです。やはりどれかを妥協しないとホテル選びは難しいと思います。
もし大都市でなくてよいのであれば、探せばあると思います。小さな街でも素敵な観光旅行が出来る所はありますよ！

カズさん、

返信が遅くなりまして、大変申し訳ありません。

サンフランシスコの１２月は風が冷たく、晴れていても寒い日が多いです。
なので、Tシャツの上に長袖のシャツや薄手のセーター、そして温かいジャケット（ユニクロの薄手のダウンとか？）を持って来られることをお薦めします。
ただし、スキーで使うような分厚いダウンジャケットは必要ないかもしれません。
アメリカの西海岸は比較的温かいイメージをよくされますが、サンフランシスコは晴れていても風が冷たい日が多いし、一日の寒暖の差もあるので、重ね着をお薦めします。

楽しいご旅行になることを願っています。