Honuさん
ヘルニアは、痛みが出ていないときはいいのですが、痛み出すと歩行が辛いですよね。
ですので、ツアーでの団体行動はお勧めいたしません。

私は、昨年、車椅子利用で、バルセロナ、トレド、セゴビア、マドリードを周遊で案内いたしました。
また、別途、バルセロナ、マドリード、トレド、グラナダ、コルドバ、セビージャにも行きました。

マドリードに連泊し、日帰りで、セゴビア、トレドをゆっくり回りました。トレドでは、ソコトレインで街を観光し、大聖堂とサントトメ教会に入りました。中世の街並みで石畳の坂道が多いですので、ツアーはかなり厳しいと思います。

セゴビアは、急な坂のところには登らず、街をのんびり散歩しました。水道橋のそばにある老舗レストランで、名物、豚の丸焼きを食べて帰路につきました。

プラド美術館の鑑賞には数日を要します。さらりと観て回るだけでも、２時間以上かかります。
結構、疲れます。

同日に、トレドとセゴビアに行くのは、物理的には可能ですが少しハードです。
このようなわけで、マドリード３泊で、これら全てを周るのは、体力的にみますとかなり厳しいかと・・・

サンミゲル市場は、バルの寄せ集めですので、営業していますが、満員電車のように超満員です。
落ち着いて食事をするにはお勧めしません。
見学だけでもいいかと思いますが・・・・（通り抜けるだけでも疲れます）

グラナダはイスラム文化の栄えた小さな街です。
アランブラ宮殿まで坂道を歩いて登るのは大変ですので、タクシーを利用なさってください。

以上、簡単なご案内となります。
お役に立てれば幸いです。

DNIは、スペインにおけるIDカード番号です。
身分証明になりますが、パスポートを選ぶことはできませんか？
（DNI, NIE, パスポートのいずれかの選択）
一般的に、日本在住の方ならパスポート番号になります。

「ファザード」とは、正面（側面）の外観のことであり、ファザードから市街を見渡すことはできません。
また、ファザードは入場しなくても、外から両方とも見学、撮影できます。

maruo-haasさんは、「生誕のファサードと受難のファサード」と区分なさっていますが、入場チケットが分かれているのは、「生誕の塔と受難の塔」のことですので、ここでは「塔」とちらえて回答いたしますね。

(1) 「朝一入場＋受難の塔、夕方入場＋生誕の塔」
塔の中から撮影されるためか、順光であることが重要のようですが、やや斜光になるのではないでしょうか。
立体的な撮影にはこの方が適しているかもしれませんね。

蛇足ですが、塔の上から撮影できる場所は非常に狭いので、私は順光かどうかを気にしたことがありません。
むしろ、礼拝堂のステンドグラスの反映時刻の方が重要です。（季節により大きく異なります）
ここで、美しい画像を貼付できないのが残念ですが、礼拝堂の柱や側面にステンドグラスがそのまま反映され、模様が浮き出ます。
わずか30分の滞在時間内でも微妙に変化していきます。
これは、採光の角度により、一定時間しか観られませんので、時間の予測が重要です。
取り分け、西日が差し込む受難の塔側のステンドグラスは素晴らしいです。
ぜひ、ご覧になって下さい。

(2) 朝一だからといって、静かだとは限りません。
チケットは、比較的、早い時間から売れていきますしので、朝イチは入口で列をなしていることがあります。（セキュリティチェックがあるため）
また、団体の入場がありますと、グループでの移動があり、混雑感があります。

塔にエレベーターで昇れば、あとはひたすら階段を下りていくだけですので、おそらく、30分内外で礼拝堂に戻ってこられるでしょう。
もちろん、次々に登ってくる人達を見過ごして、塔の中に留まることもできますが、非常に限られた狭い場所ですし、次の方に撮影場所として譲ることも必要です。
１時間前後も一人、塔の中に居残ることはちょっと不自然かもしれません。

「西日が差し込むステンドグラス」
これは(1)でもお応えしましたように、わずか30分でも変化します。

「5月上旬に教会内が美しくなる時間帯」
サマータイムですので、21時頃でも薄明るいです。
ただ、ステンドグラスの反映が美しいのは、西日の角度によります。
どの時間か具体的にお応えするのは非常に難しいです。
その時間帯、しばらく礼拝堂内に留まっていれば、美しい瞬間が撮れると思います。（実際にそのようにした方もいらっしゃいます）

(3) 5月2日（金）と5月3日（土）の混雑具合について
バルセロナに閑散期はありません。
曜日に関係なく、入場制限していますので、朝イチの15分内外は、礼拝堂にいる人数は限定的です。
その後、15分ごとに次の入場者が入ってきます。（実質的には絶え間なく、入場してきます）

あまり明確な回答になっておらず申しわけないですが、具体的にご相談いただけましたら、詳しくお調べしてお応えできると思います。

フライトの遅延等がなく、迷うことなくスムーズに交通機関を利用できるならば、時間的に移動可能です。

バルセロナまでの経由地によりますが、乗り継ぎ時にシェンゲン地域に入っておられましたら、バルセロナでの入管は不要です。
荷物をとって、すぐにホテルに向かうことができます。

列車でスタジアムに向かうならば、まず、サンツ駅まで行って下さい。（バス、メトロ、タクシーで）
そこから、EUROMEDとL1Aに乗っていくことになります。
Ctra. Onda, 10 [Vila-real]で下車し、徒歩数分で到着します。

このルートが最も徒歩距離が少ないと思いますが、他のルートもあります。
ただ、列車のダイヤが平日とは異なりますので、フライト到着時刻、ホテルに行って荷物を置く時間等により、かなり制限されてくるでしょう。
また、乗り換え駅のEstacion de Castellóまでは、中距離バスでの移動も可能ですが、渋滞など予測できない事態を避けるためにも列車の方が無難かと。

いずれにしましても、バルセロナに到着してからの行動をすべて無駄なくスムーズに運べるように準備しておく必要があります。
サンツ駅での乗車方法や乗り換え駅の情報も事前に確認しておいた方が良いでしょう。

列車の予約は、Renfe.esで取れます。
Omioは、仲介会社になりますが、日本語表示があるので使いやすいかもしれません。

この時期、まだ暗く、人通りも少ないので、どちらも安全とは言えません。

バス停よりも、ホテルからバス停までの道中にお気をつけください。

第1日曜日の無料チケットは、前週の木曜日に販売されます。
入場者数をコントロールしていますので、チケットなしでは、入場できませんのでご注意ください

始発駅で満席になってしまえば、スペイン広場には停車せずに通過します。
ご注意ください。

モロッコについては、観光内容が分かりませんので何とも言えませんが、スペインとポルトガルで6日間ということは、ほぼ連日、移動しなければなりません。
ホテルチェックイン・アウトの時間もありますし、空港や列車、埠頭までの移動にも時間を要しますので観光時間は削減されるでしょう。

観光のポイントが何なのかによりますが、コストを抑えてということでしたら、単に移動するだけの旅となりそうですよ。
さらに、各観光施設は事前予約が必要です。
しっかり、プランをたてておく必要があります。
宜しければ、プラン作成を承ります。

Copa America開催中は、あの辺のお店は全て閉鎖されていましたが、大会が終了して、昨年秋からリニューアルオープンしています。
地中海に面したテラスも80席あります。
日本からお越しの方によくご案内しておりますが、大変、好評です。

①タクシーを使う場合などの注意点を伺いたいです。
空港のタクシー乗り場には黄色いベストを着た係員がいますので、人数や荷物によって順次、乗車タクシーを指示してくれます。
オフィシャルな配車なら、特に問題ないと思いますが、メーターをオンにしているかどうかくらい見ておいた方がいいかもしれません。

②マドリードへの交通手段について
私は、マドリードへの移動には決して飛行機を使いません。
時間によっては列車より安いかもしれませんが、空港から市内への移動経費や時間がかかります。
また、天候によって、遅延、欠航の心配もありますので、私は列車の方が便利で結果的に経済的だと思っています。

③その他おすすめスポットについて
市内
サグラダ・ファミリア
カサ ミラ
カサ バッジョ
グエル公園
グエル邸
カタルーニャ音楽堂
サン パウ病院
ミロ美術館
ピカソ美術館

郊外（半日強）
モンセラット
コロニア グエル教会
ダリ美術館

このあたりが王道かと思います。